Nada acontece quando um servidor é parado com /stop: sua mensagem de parada deve conter um dos planned-shutdown-messages (veja shutdown-message no bukkit.yml ou a mensagem que o seu plugin de reinicialização usa).
"config.yml is not valid: line N ..." na inicialização: o VelorFailover fica inativo. Corrija a linha e execute /velorfailover reload.
Os jogadores não são redirecionados: verifique /vf status; os dois servidores devem aparecer como online quando a expulsão vem do que caiu, o servidor alternativo deve estar registrado no velocity.toml e a rota deve existir em fallback-routes.
Um comando de troca não faz nada: outro plugin pode ser dono desse nome (veja o aviso da inicialização) ou o destino não está no velocity.toml.